灌肠在明朝开始流传。《故都食物百咏》中提到煎灌肠说：“猪肠红粉一时煎，辣蒜咸盐说美鲜。已腐油腥同腊味，屠门大嚼亦堪怜。”老北京街头常有挑担小贩经营此食品。有记载：“粉灌猪肠要炸焦，铲铛筷碟一肩挑，特殊风味儿童买，穿过斜阳巷几条。
清末民国初经营灌肠的食摊，都是用淀粉加红曲水调成稠糊面团，做成猪肠形状，蒸熟以后，晾切成薄片，在饼铛内用猪油煎焦，取出盛盘，淋盐水蒜汁，趁热食用。后门桥一带的福兴居算是老字号，距今有200年左右历史因其灌肠煎得地道，人们管它叫北京灌肠铺，1917年才取名福兴居。至于庙会、集市上摊贩卖的灌肠，乃是用淀粉加红曲，团之为肠形，蒸熟成“粉灌肠”。卖是以刀削成菱形小块，于平锅内用次汤油煎焦，盛于碟内，浇上盐水蒜汁，让顾客用竹签所着吃。是一种平民化的经济小吃。
1927年在福兴居对面又开了一家合义斋灌肠铺，对制法加以改进，除用红曲水调制面糊，还加入丁香、豆蔻等10多种香料，并把面糊灌入真猪肠内，蒸熟切片，并用油煎，使之更加香脆咸辣，成为一道风味独特的佐酒菜，因而享有盛誉。当时拉洋车的、做小买卖的、当壮工的以及青年学生，都喜欢到后门桥来吃煎灌肠。这种灌肠才是真正的灌肠，但已经找不到了。另一种就是用淀粉加红曲水调成稠糊，蒸熟后切小片块，用猪油煎焦后，浇盐水蒜汁食用。其实这一种当时称攥肠，或者叫煎粉灌肠，但由于前一种已经消失，灌肠这名字就被纯淀粉独享了。 合义斋百年历史的老字号名店，汇聚了北京城各式经典小吃，古色古香的明清装修风格和宽敞明亮的大堂，着实给人一种舒适亲切的感觉。炸灌肠，清乾隆年间已是风靡京城的小吃之一。合义斋的炸灌肠那在北京可是赫赫有名，听老辈说“口味是最接近古老灌肠的”。秘诀就是合义斋在沿袭传统制作方法上，更加追求选料精细，将精选的猪肠洗净切碎，加入有着百年历史的秘制调料和淀粉，捏成棒槌形，蒸熟切片，再用“猪网油”小煎一下，盘中的炸灌肠，色泽微红，食在口中，香脆绵软，再蘸上蒜汁、盐水的小料，略有一丝辣味，让馋嘴的您直呼爽口过瘾，回味悠长。北京著名的隆福寺东口有一家专营京味小吃——“灌肠”的丰年小店，已有50多年的历史了。北京人爱吃这里的灌肠，主要是这个小店，一直执著追求京味灌肠的传统风味和恢复京味新品种。这里重新装修，扩大了店堂，2.50元一盘的京味灌肠，颇受欢迎。
灌肠是北京人最爱吃的京味小吃之一，它的出身可谓历史悠远，早在明万历年间的《酌中志》和清乾隆年间的《都门竹技词》中均记有“爆肚油肝香灌肠”和“灌肠红粉一时煎，辣蒜咸汁说美鲜”等诗句。50年前丰年小店，就在隆福寺街专营北京风味灌肠。它从原料、烹制和小作料等，一直追求它的传统口味。主料是选用性味甘、平的甘薯淀粉，经蒸熟晾凉，切菱形薄片，平锅煎焦。吃灌肠浇的蒜汁，一直沿用传统的石臼捣制蒜泥，将外焦里嫩的灌肠，浇上咸味蒜汁，别有风味，一些老北京赞扬说：这才是地道的京味灌肠。小店还增添了京味的“门钉肉饼”也很受欢迎。另外，这里零售生灌肠，吃时切成小片，用油煎焦，浇点咸蒜汁即可。