区别：参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目,集中列表于文末；脚注主要包括释义性注释和引文注释,一般排印在该页地脚或集中列于文末参考文献表之前。
脚注，是汉语词汇，汉语拼音为就是可以附在文章页面的最底端的，对某些东西加以说明，印在书页下端的注文。脚注和尾注是对文本的补充说明。脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释；尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。
详细解释
郭沫若《文艺论集续编·桌子的跳舞》：“我在《资本论》的脚注里面发现出引用了这一句有趣的话。”巴金《后记》：“但是过了一年我还是从那篇未用的后记中摘出一部分作为一篇散文的脚注塞进我的《文集》第十卷里面了。”
脚注和尾注是对文本的补充说明。脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释；尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。
脚注和尾注由两个关联的部分组成，包括注释引用标记和其对应的注释文本。用户可Word让自动为标记编号或创建自定义的标记。在添加、删除或移动自动编号的注释时，Word将对注释引用标记重新编号。
参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。
按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T7714-2015《信息与文献参考文献著录规则》”的定义，文后参考文献是指：“为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《中国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为“对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字”，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。