藤野先生是一位辛勤治学、具有诲人不倦的精神的老师，他正直、热忱、高尚，没有民族偏见。藤野先生对中国留学生孜孜不倦的教诲及对学生的一视同仁，这与日本学生对中国学生的轻蔑态度形成了鲜明的对比，体现出藤野先生是个真正的君子。
作者通过怀念藤野先生，赞扬藤野先生没有民族偏见的伟大性格和正直、热忱、高尚的品质，回顾了自己在日本求学时期探索救国道路和思想转变的过程：
为了祖国的前途和命运，毅然地放弃了跟随生平最敬爱的老师一一藤野先生学习医学，摈弃了科学救国的改良主义道路，改为从事文艺运动以唤醒人民群众起来革命；从而激励自己要永远不忘革命的初衷，决心同封建及帝国主义势力斗争到底。
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艺术特色：
1、对比手法：如写作者满怀爱国激情寻求救国的道路，而“清国学生”则过着饱食终日、白天逛公园、晚上跳舞的无意义生活，二者形成鲜明的对比。
又如“清国留学生”是中国人，对祖国的前途漠不关心，而藤野先生是日本人，却热望把新的医学传到中国去；这二者也形成鲜明的对比，还有以学生会干事为代表的日本“爱国青年”妄自尊大，仗势欺人，而藤野先生却毫无民族偏见，对弱国留学生热心教诲，关怀备至，形成了强烈对照。
2、白描手法：在描写人物方面，作者运用了白描手法。如写藤野先生时，无论写他声调缓慢而很有顿挫的自我介绍、耐心细致改正鲁迅的听课笔记和解剖图、看到鲁迅成功地进行了解剖实习的高兴状况以及鲁迅要离开仙台时的依依惜别之情，都只是简练的几笔，没有粉饰，没有渲染，但写得栩栩如生，显示出人物鲜明的性格。