侯登科代表作有《子弟》（1983）、《成人》（1983）、《出征》（1986）、《四方城》（1997）、《麦客》（2001）等。1987年，参与发起并组织对中国摄影界产生巨大影响的《艰巨历程》全国摄影公开赛，以及其后的《中国摄影四十年》大型摄影画册的策划；曾先后发表《现状与思考》（1986）、《自觉的历程》（1987）、《以现实的名义》（1999）等长篇文论。 麦客，是西北人的叫法，即在夏收时节相帮着乡民割麦的另一群乡民。麦客多来自于陕甘宁三省，流徙于关中东部，临潼至潼关诸县，渭河两岸及河川塬上。建国前，麦客们全靠脚力、体力、耐力，白天“赶场”顶烈日，晚上“转场”披星月，几十里路不在话下；建国后，随着交通条件的改变，他们再也不用百里千里地的步行赶场了；1980以后的麦客，人腕上戴着手表，扒火车、乘客车、坐汽车而来，并随着农村责任田的实行，麦客迎来了其黄金时代；1990年代开始，收割机逐渐抢占了麦客的地盘，麦客们的“规模经营”之势渐缩。
侯登科，用数年精力，追踪拍摄这些兄弟般的麦客，用照相机记录下麦客的黄金时代以及麦客由盛而衰的柳编过程。他的作品，不强调视觉冲击力和快捷感，朴素、简单，但是沉重和严酷，充斥着浓郁的黄土高原气息……
艺术批评家杨小彦在《他们的历史》一文中说：“麦客是一群生活在‘历史叙述’大门之外的人。主流社会的历史是‘我们的历史’，侯登科力图以镜头叙述‘他们的历史’，并且使得‘他们的历史’演变成‘他们反映的历史’”。 《四方城》是胡武功、侯登科、邱晓明三位陕西籍摄影家于1997年推出的摄影画册，拍摄地为西安。“四方城”来自于对于西安城墙，三位摄影家拍摄采取的平视的视角，凝视寻常百姓，以现代都市人的心态记录了西安社会大众的真实生存状态，以反映特定时空的地域文化景观。
贾平凹评价说：“以这么大的热情和朴实无华的镜头，这么真实地记录一个城市的百姓生活，在中国摄影史上还并不多见吧。而在这些作品中，从人与城的关系、人与人的关系、人和城与时代的关系里，竟能表现出如此丰富的历史性、哲理性和艺术性！ ” 侯登科一直有一个愿望:拍摄黄土地上的女人、回报给予他生命的女人、向自己的母亲和妻子致敬,但英年早逝的他没能看到自己的愿望实现。在他去世后的两年里,朋友们帮他实现了这个梦想——侯登科遗作展《黄土地上的女人》。
有评论说：“侯登科热爱生活。他懂女人，也很会拍女人，于是他的画面里就有了很多的女人：柔和的女人，温婉的女人，丰腴的女人，朗润的女人，沉郁的女人，干练的女人，可堪哀怜的女人……他穿过女人的绿色走廊，从女人那里体验生命的根相。感受震动生命的整体流动。女性，是从儿时开始便在精神上引领他上升的依靠。 ”