写作目的不同：《三峡》主要是为了客观地介绍地理知识,而《与朱元思书》则突出了对大自然的赞赏,而且写出作者的内心感触.
在描写上：《三峡》在写景色方面突出了四时的变化；写山时,还突出了山的连绵不断.
在形式上：《三峡》是散文,而《与朱元思书》是骈文.
两文的主题有明显的差异，《三峡》的作者是一位四处游荡的散文家，文章不仅抒发作者对祖国大好河山的热爱，还流露出一种作者长期在外形成的思乡之情，《与朱元思书》的作者是一位向往自由和自然的官员，文章也表达了作者对祖国壮丽山河的赞美和作者对官场的厌恶，对大自然的向往和隐退山林的心愿。