顺治皇帝是因为得了天花去世的。
据清史稿记载顺治帝是在1661年因为得了天花医治不好驾崩的，在顺治帝驾崩了以后，他的棺椁停放在了景山的寿皇殿。
到1661年四月十七号由高僧行森进行火化，火化以后灵柩安放在清东陵的孝陵庙号清世祖，谥号为庙号世祖，谥号体天隆运定统建极英睿钦文显武大德弘功至仁纯孝章皇帝。
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关于顺治皇帝的死因还有一个无从考证的说法是说顺治皇帝出家为僧。相传，顺治皇帝迷恋上一位江南名妓董小宛，而顺治的母亲孝庄皇太后对此极为不满，设计害死了董小宛。
当时一位很有名气的诗人吴梅村，写下了一首《清凉山赞佛诗》。诗中写道：陛下寿万年，妾命如尘埃。愿***南山椁，长奉西宫杯。
当时顺治皇帝与董小宛的故事传得沸沸扬扬，人们不免猜想，吴梅村在诗中所写的陛下，就是顺治皇帝。
清宫内国史院满文档案记载，顺治皇帝14岁那年，在遵化打猎时，认识了一位在山洞内静修的法师。从这以后，顺治与佛教结下了不解之缘。
顺治十四年，在太监的精心安排下，20岁的顺治在京师海会寺同高僧憨璞聪见面。憨璞聪对佛法的阐释深深触动了顺治。从此，顺治对佛教产生了浓厚的兴趣。
顺治崇佛已久，而且早有出家之意，董鄂妃死后，他曾经一度伤心欲绝，无心朝政，病逝于养心殿也许仅仅是个对外托词，顺治并没有死，而是遁入空门，削发为僧了。
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