余姓来源有四：1、春秋时秦由余之后。据《风俗通》所载，余姓为“由余之后，世居歙州，为新安大族，望出下邳、吴兴。”以字名为氏。2、据《姓考》所载，相传夏禹之有余氏。3、出自赤狄族，为隗姓之后。据《国语》所载：“潞、洛、泉、余、满五姓，皆赤狄隗也。”4、由他族和他姓改姓而来。如云南镇雄县余姓，原复姓铁木，有诗为证：“余本元朝宰相家，洪兵赶散入西 ……前传诗句词如此，后嗣相逢系本家”，（见《余氏总谱》），另僳僳族以鱼为图腾的挖饶时氏族，汉姓为余；羌族余约志房名，后改为余；四川、甘肃一带白马藏族之严茹氏，热则氏、陪茹氏等汉姓为余；锡伯族余木尔其氏汉姓为余；其他如苗、彝、布依、满、土家、白、保安、羌等民族均有此姓。
得姓始祖 由余。春秋时秦国的大夫，也作繇余。其祖先原为晋人，逃亡入西戎（古代西北少数民族的泛称）。初在西戎任职，后奉命出使秦国，见秦穆公贤德大度，便留秦国为相，很得穆公信任。时秦作为众多诸侯国之一，其地位并不显要。由余为上卿后，果然不出穆公所望，他助秦穆公谋划攻伐西戎之策，灭国十二，拓地千里，而称霸西戎，最后使秦穆公成为春秋五霸之一。由余因曾为秦国富强、统一天下奠定了坚实的基础，后人引以为荣，遂以其字为氏，尊其为余姓的得姓始祖。
繁衍播迁 春秋时的秦国，建都于雍（今陕西风翔东南），占有今陕西中部和甘肃东南端，由余的后裔在春秋时应繁衍于这一带。秦汉以后，余姓族人东迁，一支迁入陕州（今河南省三门峡市陕县）；一支迁居江南，主要繁衍于今安徽。在我国的北方和南方，余姓的后人基本上是同时不断地繁衍滋长，但北方较南方发展态势要弱得多。魏晋南北朝时，余姓已成为新安郡一带望族。此际，北方战火连绵，社会动荡不安，中原士族开始第一次大举南迁，余姓大族所处之地正当其冲，故其南迁也就不可避免。其中有一部余姓族人继续南迁，进入湖北、湖南等地。南朝宋有余齐民，晋陵（今江苏常州）人，以孝行著称，为唐代以前唯一见诸史册之余姓人物。唐代以后，余姓才得以迅速繁衍壮大起来，并逐渐在东南部一带形成两处望族。唐初，陈元光父子入闽开漳，有余姓将佐随往并落籍福建。唐末，有建阳（今属福建）人余镐在黄巢攻陷建州时，避居莆田，后耕隐壶山以终；还有余渊海因避黄巢兵，自福建同安北迁邵武，于唐僖宗光启年间再转入韶州曲江县（今属广东）武溪，是为余姓入粤始祖。此后不久余渊海次子余咸徙居湖南长沙，三子余衮迁居浙江杭州，长子余从留居当地。其三子后裔又有迁江西之奉新、临川、广东之五华、梅州、大埔、平远、海丰等地者。到了宋代，余姓基本上遍布全国，而且人才济济。明洪武年间，余姓作为洪洞大槐树迁民姓氏之一，被分迁于陕西、甘肃、河南、山东、江苏、浙江、河北、安徽等地。明清之际，余姓不仅遍及江南各地，而且北方之余姓也得以繁衍发展。清代，有余姓自福建迁至台湾，此后又有移居海外者。如今，余姓分布广泛，尤以四川、广东、江西、云南、河南、湖北、安徽等省多此姓，上述七省余姓约占全国汉族余姓人口的百分之七十七。