董仲舒的理论是集儒家、玄学和政治于一体。顺应天时地利人和，应运而生。
主观上他是将理论和政治结合，目的是使儒家思想理念更容易被统治者接受，发挥儒家思想的作用，从而实现天下大治。
但他的理论仍然摆脱不了被统治阶级利用的宿命，实际结果是更加方便了统治阶级利用儒家禁锢人民群众的思想，使阶级固化，强化统治地位。
董仲舒以《公羊春秋传》为基础，将自周以来的宗教天道观与阴阳，五行学说相互结合，并借鉴法家、道家和阴阳家的思想，建立起了一个新的儒家神学思想体系，并成为汉代的官方哲学，对当时社会的一系列哲学、改治、社会、历史问题，都给予了比较系统的回答，成为儒家思想发展的重要的关节点。董仲舒的著作很多，至今留存下来的有《春秋繁露》及《全汉文》两卷。
所谓今文经学，是用秦汉以来流行的隶书写的解释《春秋》的文章，首先作这种文章的就是董仲舒。除了这类研究经学的文章，董仲舒还整理了各次上疏的文章和其他一些议论性的文章。史书上说他一***写了一百二十三篇，然而到现在大部分已经失传，流传下来的有十余万字左右。《春秋繁露》大致上反映了董仲舒的思想，然而他在书中掺杂了不少神学内容，从头至尾都贯彻着他的神学观。重复了自己关于阴刑阳德的说法。
从儒家的思想出发，在《春秋繁露》中表达了“仁义”的改良主张。董仲舒还把“天人感应”的思想也融进了文章中。他说王者能起参天地的巨大作用，广大“民”“众”也能影响上天。更重要的是他把“四权”和“三纲五常”在书中归纳了出来，认为君为臣纲，父为子纲，夫为妻纲是上天的意志。