佛说七窍玲珑心的含义，可以从两个角度来理解：
1、传说中的含义：传说中的“七窍玲珑心”是指一颗天生有七个洞的珍奇心脏，这样的人心灵异常纯洁，心性与自然相和。他们天生就能聆听万物的心声，可以与万物交流，被认为天赋异禀。在小说《封神演义》中，比干就拥有这样一颗心，相传可以与世界万物交流，能使双目破除一切幻术，重伤者食用心脏可有治愈之效。
2、修行和智慧的象征：从修行和智慧的角度来看，七窍玲珑心被视为一种智慧心，善善心，意味着通过修行，打通身上的七窍，智慧就打开了，从而达到开悟的状态。需要注意的是，传说中的“七窍玲珑心”实际上并不是指的“心上七个洞”，因为正常心脏内只有一个房间隔和一个室间隔，把心脏内分成左右两个心房和左右两个心室***四个腔。所以“心七窍”，更多的是类比规律，也就是类应，古人以人心汇聚意识，在外对应头部七窍的功能。而“七窍玲珑心”最初是源于这样一个传说，古语“巧”通“窍”，于是七巧玲珑心则是指心脏上有七个孔，形容拥有这样一颗心的人十分聪明。